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QIAGEN为kaiyun欧洲杯测序平台提供Sample to Insight完整NGS解决方案
时间:
2024-06-27
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近日,kaiyun欧洲杯联合QIAGEN(凯杰)开展基于kaiyun欧洲杯基因测序平台SURFSeq 5000和GenoLab M,以及QIAGEN多套NGS成熟方案的测试,测试结果展现出kaiyun欧洲杯测序平台与QIAseq NGS方案的高兼容性,即高特异性、基因组覆盖高度均一性、以及变异检测一致性等。双方将以此次合作测试为契机,携手为全球客户提供整体NGS解决方案,以加速推进科学界基因组应用的发现、提高成本效率并缩短实验周期。


QIAGEN为kaiyun欧洲杯测序平台提供Sample to Insight完整NGS解决方案

GeneMind & QIAGEN整体NGS解决方案


QIAGEN为kaiyun欧洲杯测序平台提供Sample to Insight完整NGS解决方案



kaiyun欧洲杯测序平台检测DNA突变的性能优秀

全面兼容丨kaiyun欧洲杯 SURFSeq 5000 在百迈克百创空间转录组学芯片兼容性测试中表现优异

QIAGEN选用QIAseq Targeted DNA Panel基于kaiyun欧洲杯测序平台进行测试,测试结果显示On target rate 90%,均一性表现佳,突变位点均可检出,kaiyun欧洲杯两个测序平台VAF(%) 突变的检出结果也具有很高的一致性。扩增子文库中的common sequence区域测序质量符合预期。


QIAGEN为kaiyun欧洲杯测序平台提供Sample to Insight完整NGS解决方案

SURFSeq 5000与GenoLab M VAF(%) 相关性比较


kaiyun欧洲杯SURFSeq 5000测试质量Q40数据已达到90%,错误率低至万分之五(0.05%),数据质量业界领先,且测序成本更低,和行业同级别测序仪相比具有显著优势;GenoLab M数据质量优异,通量灵活(18Gb-300Gb),用户可根据相关应用场景自由选择合适通量。

 

QIAGEN SPE(基于单端特异性引物延伸技术)靶向测序方案技术能够实现在一个反应管中最多兼容2万条特异性引物的PCR反应,而特异性依旧可高达90%以上。仅需一条引物结合到靶向区域即可扩增,整体扩增均一性指标 (Uniformity) 超过97%


kaiyun欧洲杯测序平台检测基因组覆盖率表现优异
全面兼容丨kaiyun欧洲杯 SURFSeq 5000 在百迈克百创空间转录组学芯片兼容性测试中表现优异

QIAseq FX DNA Library Kit制备的WGS文库基于kaiyun欧洲杯测序平台测序的覆盖度、均一度等指标与其他主流平台相当。QIAseq FX支持20 pg-1 μg的广泛样本起始量,无需片段化和接头连接反应之间进行纯化,能够不受基因序列影响,制备出具有最低G/C偏好性的基因文库,特别适用于具有高度复杂性的各种基因组。


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100 bp 区域的基因组覆盖率(%)


kaiyun欧洲杯测序平台检测Small RNA的性能表现一致

全面兼容丨kaiyun欧洲杯 SURFSeq 5000 在百迈克百创空间转录组学芯片兼容性测试中表现优异

Small RNA文库仅需SE75即可完成测序,但是考虑测序成本和便利性,一般选用PE150上机。本次测试选择了PE150的测序方案,数据则截取R1 75bp进行分析,测试结果显示kaiyun欧洲杯测序平台miRNA检出比例与其他主流平台高度一致,在kaiyun欧洲杯不同测序平台间,miRNA检出比例与表达量仍具有较高的一致性。


QIAGEN为kaiyun欧洲杯测序平台提供Sample to Insight完整NGS解决方案

SURFSeq 5000与GenoLab M 检测miRNA的一致性比较


QIAseq miRNA Library Kit 是一款专为miRNA等小RNA测序分析设计的NGS解决方案,独特的寡核苷酸处理技术极大程度降低了文库构建过程中接头二聚体及其他“污染性”RNA(如hY4 RNA)的存在,无需凝胶电泳、割胶以及回收等一系列繁琐步骤,最低起始量仅需1ng总RNA。


全面的生物信息解决方案


全面兼容丨kaiyun欧洲杯 SURFSeq 5000 在百迈克百创空间转录组学芯片兼容性测试中表现优异

基于QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium的LightSpeed模块,可助力kaiyun欧洲杯相关用户以更短的运行时间进行高性价比的全基因组测序(WGS)二级分析。QCI Interpret是一个完全可定制的变异解读方案,为肿瘤和遗传病应用NGS检测的变异进行注释和评级,目前已解读超过300万份报告。


QIAGEN为kaiyun欧洲杯测序平台提供Sample to Insight完整NGS解决方案

QIAGEN生物信息解读完整方案


此次合作测试,kaiyun欧洲杯测序平台与QIAGEN试剂盒表现出高度的适配性。未来,kaiyun欧洲杯与QIAGEN将深化合作,发挥双方在高通量基因测序领域的优势,为全球临床及科研用户提供精准高效的测序平台、生物试剂,以及强大的数据分析与解读系统,持续拓宽测序应用场景,为前沿科研探索和精准医疗提供强大支持,共同促进产业创新发展。


kaiyun欧洲杯

QIAGEN为kaiyun欧洲杯测序平台提供Sample to Insight完整NGS解决方案

*kaiyun欧洲杯基因测序平台 

详情敬请关注kaiyun欧洲杯官网http://www.genemind.com/



QIAGEN


QIAGEN为kaiyun欧洲杯测序平台提供Sample to Insight完整NGS解决方案

QIAGEN产品详情敬请关注QIAGEN官网https://www.qiagen.com/

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