测序平台：GenoLab M、NextSeq 500、NovaSeq 6000

样本信息：人源细胞系标准品（NA12878）

解读链接：

https://mp.weixin.qq.com/s/6Htb78TVanj37cufbZc48g

测序平台：NovaSeq 6000、NextSeq 550、GenoLab M、FASTASeq 300、SURFSeq 5000

样本信息：肿瘤样本HD832和正常样本HG001

解读链接：

https://mp.weixin.qq.com/s/25Qy3kuGe0gZ0R-_SUK8lw

测序平台：GenoLab M、NextSeq 2000

样本信息：3例卵巢癌患者的肿瘤组织FFPE样本

解读链接：

https://mp.weixin.qq.com/s/OieIm6iiFuzUc_9yF7PvLg

测序平台：GenoLab M、NovaSeq 6000、NextSeq 550、MGISEQ 2000、FASTASeq 300、SURFSeq 5000

样本信息：FFPE标准品HD832、cf DNA和cell line

解读链接：

https://mp.weixin.qq.com/s/sZ7a7FdME-whLxkqniLDiA

文章题目：Accumulation of Endogenous Adenosine Improves Cardiomyocyte Metabolism via Epigenetic Reprogramming in an Ischemia-Reperfusion Model

发表期刊：Redox Biology

影响因子：11.4

发表年份：2023

解读链接：

https://mp.weixin.qq.com/s/wUiX9zEZYZB_OCmfFl7d0Q

文章简介：复旦大学附属中山医院孙爱军和葛均波院士团队研究探讨了心脏细胞中腺苷激酶（ADK）在心肌缺血再灌注（I/R）损伤中的作用，并探索了其作为治疗靶点的潜力。通过抑制ADK，可以导致心肌细胞内腺苷积累，降低DNA甲基转移酶1（DNMT1）的表达，并引起基因组的低甲基化。此外，ADK敲除还增加了胰岛素样生长因子-1（IGF-1）的转录，促进心肌细胞的葡萄糖代谢。研究者构建了不同时间点的I/R小鼠模型，使用GenoLab M测序仪对I/R组和对照组样本进行了转录组测序。结果表明：相比对照组，ADK的表达在I/R组显著上调。通过ADK相关通路分析发现，在I/R组中，ADK、DNMT1和其他代谢相关基因发生了显著变化。

图2 ADK被发现是参与I/R期间代谢变化的潜在候选基因

文章题目：Single-Molecule m⁶A Detection Empowered by Endogenous Labeling Unveils Complexities Across RNA lsoforms

发表期刊：Molecular Cell

影响因子：14.5

发表年份：2025

解读链接：

https://mp.weixin.qq.com/s/qyFb7XkT9QgGALCry2TKjw

文章简介：中山大学中山医学院王金凯教授研究团队开发了一种名为m6Aiso的深度学习模型，在牛津纳米孔直接RNA测序的单个读长上检测m⁶A修饰。训练该深度学习模型是基于内源性标记产生的上百万个单分子m⁶A阳性电信号。该研究揭示了：1、不同m⁶A位点在单分子上存在距离依赖的连锁；2、相同的m⁶A位点在不同的异构体上也能够通过三种不同的机制产生广泛的差异；3、转录因子SMAD3在上皮-间充质转化过程选择性调控m⁶A，与SMAD3结合的启动子异构体的m⁶A显著上调，形成异构体特异的m⁶A调控。m6Aiso技术为研究m⁶A修饰的复杂性和动态变化提供了新的工具，为理解m⁶A在异构体上的复杂性提供了新的视角。此外，研究者还采用kaiyun欧洲杯的SURFSeq 5000平台完成了A549细胞系的GLORI测序，为m6Aiso 在多个细胞系中的准确性评估提供了有力的支撑，同时也反映了SURFSeq 5000平台进行二代高通量测序具有高度的可靠性。

图4 m⁶A在单reads上的内源性标记和m6Aiso在单分子水平上的结果评价

文章题目：Improving Seed Shattering Resistance in Wild O. alta Rice with Mesoporous Silica Nanoparticle Delivery Systems

发表期刊：Nano Letters

影响因子：9.6

发表年份：2024

解读链接：

https://mp.weixin.qq.com/s/GsXpfZvKzK18Mg7W6gx16Q

文章简介：国家纳米科学中心曹宇虹研究员团队通过介孔二氧化硅纳米颗粒递送系统（MSNs）对四倍体野生稻（Oryza alta）的落粒性进行改良。基于kaiyun欧洲杯SURFSeq 5000高通量测序平台的转录组测序结果，研究团队分析了落粒相关基因沉默后细胞壁和纤维素合成相关基因转录组水平变化，发现落粒相关基因SH02表达下调，木质素沉积相关基因CAD2、CCR19、PAL1、COMT表达上调，差异基因的GO富集与细胞壁的定位和纤维素的合成相关。通过进一步的分子生物学实验，证实了落粒相关基因的沉默显著减少了水稻籽粒与小穗之间的离层形成，增强了小穗的抗拉强度。本研究证实MSN-siRNA递送系统是一种灵活、有效的作物性状改良方法，为实践可持续农业发展提供了一个有前景的工具。

图6 MSN-siRNA递送系统

文章题目：Hybrid sequencing for detailed genetic characterization of human adenoviruses

发表期刊：Scientific Reports

影响因子：3.8

发表年份：2024

解读链接：

https://mp.weixin.qq.com/s/UZSVH0ka47G2WaLlymwwGw

文章简介：湖北省疾病预防控制中心基于kaiyun欧洲杯FASTASeq 300和ONT MinION Mk1C测序平台，对26例腺病毒（HAdV）阳性的上呼吸道感染患者样本进行了测序并深入分析。通过ONT长读长和FASTASeq 300短读长测序的混合组装，成功获得32条完整组装的HAdVs基因组，并对其进行了全方位剖析，为HAdVs流行病学调查及公共卫生安全提供了新的见解。研究者发现，结合长读长和短读长的杂交测序，可以获得准确的HAdVs基因组，并且发现潜在的共感染。

图7 HAdVs全基因组进化树及多样性分析